图书介绍
R语言与Bioconductor生物信息学应用PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- 高山，欧剑虹，肖凯主编 著
- 出版社： 天津：天津科技翻译出版有限公司
- ISBN：9787543333604
- 出版时间：2014
- 标注页数：232页
- 文件大小：50MB
- 文件页数：242页
- 主题词：程序语言－程序设计－应用－生物信息论
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图书目录
第一章 R基础知识1
1.1什么是R1
1.2 R的下载与安装9
1.3 R语言快速入门17
1.4一些简单的语法知识19
1.5本章源代码详解及小结21
第二章 生物信息学基础知识28
2.1中心法则——生物信息流28
2.2测序与序列分析33
2.3基因表达分析40
2.4注释、统计与可视化44
第三章 R在生物信息学中的简单应用47
3.1一个序列分析课题47
3.2用R包（非Bioconductor）实现课题49
3.3用R包（Bioconductor）再实现课题（方法一）65
3.4用R包（Bioconductor）再实现课题（方法二）70
第四章 Bioconductor简介80
4.1什么是Bioconductor80
4.2 Bioconductor的分类介绍83
4.3从R到Bioconductor的跨越90
第五章 Bioconductor分析基因芯片数据108
5.1快速入门108
5.2基因芯片基础知识109
5.3基因芯片数据预处理112
5.4基因芯片数据分析132
5.5芯片处理实际课题一143
5.6芯片处理实际课题二147
5.7芯片处理实际课题三150
第六章 Bioconductor分析RNA-seq数据157
6.1示例课题介绍157
6.2高通量测序基础知识158
6.3 RNA-seq技术的特点168
6.4 RNA-seq数据预处理170
6.5 RNA-seq数据分析180
第七章 R的高级语法与如何创建R包187
7.1 R的高级语法187
7.2创建及发布自己的R/Bioconductor包199
7.3 R包结构208
附录A 进一步学习的资源211
附录B R常用函数216
附录C R的内存管理和帮助系统221