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第一章 微生物学的研究领域和历史1

为什么要学微生物学？2

微生物学的研究领域3

微生物3

微生物学家4

历史渊源6

疾病的微生物理论9

早期研究9

巴斯德的其他贡献10

科赫的贡献10

传染病的控制工作11

微生物学中特殊领域的出现12

免疫学12

病毒学12

化学疗法13

遗传学和分子生物学14

明天的历史15

基因组学18

知识点回顾18

临床案例研究19

辩证思考题19

自测题19

网上学习20

第二章 化学基础21

为什么要学习化学？22

化学结构单元与化学键22

化学结构单元22

原子结构22

化学键24

化学反应25

水及溶液25

水25

溶液及胶体26

酸，碱以及pH值26

复杂有机分子28

碳水化合物28

脂类29

蛋白质32

核苷酸及核酸34

知识点回顾36

临床案例研究37

辩证思考题37

自测题37

网上学习38

第三章 显微镜与染色技术39

显微镜的历史40

显微镜原理40

公制单位40

光的属性：波长和分辨率41

光的特性：光和物体42

光学显微镜44

复式光学显微镜44

暗视野显微镜44

相差显微镜45

诺尔马斯基（微分干涉差）显微镜45

荧光显微镜45

共聚焦显微镜46

数字显微镜46

电子显微镜47

透射电子显微镜47

扫描电子显微镜48

扫描隧道显微镜49

光学显微镜技术51

光学显微镜的样品制备51

染色原理51

知识点回顾54

临床案例研究55

辩证思考题56

自测题56

网上学习57

第四章 原核细胞与真核细胞的特征58

细胞的基本类型59

原核细胞60

大小、形状和排列60

结构概观60

细胞壁62

细胞膜66

内部结构67

外部结构69

真核细胞72

结构概观72

细胞质膜72

内部结构73

外部结构75

内共生进化76

物质跨膜运输78

简单扩散78

易化扩散78

渗透作用79

主动运输80

细胞内吞和细胞外吐80

知识点回顾81

临床案例研究82

辩证思考题82

自测题82

网上学习84

第五章 新陈代谢的基本概念85

新陈代谢：概述86

酶87

酶的特性87

辅酶和辅因子的特性88

酶的抑制89

酶促反应的影响因素90

厌氧代谢：糖酵解和发酵91

糖酵解91

糖酵解的替代途径91

发酵92

有氧代谢：呼吸作用94

克雷布斯循环94

电子传递和氧化磷酸化95

获取能量的意义97

脂肪和蛋白质的代谢98

脂肪代谢98

蛋白质代谢99

其他代谢途径99

光能自养99

光能异养100

化能自养100

能量的利用101

生物合成101

跨膜运输和运动101

生物发光102

知识点回顾103

临床案例研究104

辩证思考题104

自测题104

网上学习105

第六章 细菌的生长和培养106

生长和细胞分裂107

微生物生长的定义107

细胞分裂107

生长阶段107

细菌生长的测定109

细菌生长的影响因素113

物理因素113

营养因素116

芽孢形成118

其他类似芽孢的细菌结构119

细菌培养119

获得纯培养物的方法119

培养基120

复合检验的方法123

活的，但无法培养的微生物125

知识点回顾125

临床案例研究126

辩证思考题126

自测题126

网上学习127

第七章 微生物遗传学128

遗传学概述129

遗传基础129

核酸在遗传信息储存和传递中的作用130

DNA复制131

蛋白质合成132

转录132

RNA的种类133

翻译134

代谢调控137

调控机制的意义137

调控机制的分类137

反馈抑制137

酶诱导138

酶的阻遏138

突变140

突变类型及其效应140

表现型改变141

自发突变和诱变141

化学诱变141

辐射诱变142

DNA修复142

突变的研究143

Ames实验146

知识点回顾147

临床案例研究148

辩证思考题148

自测题148

网上学习150

第八章 基因传递和基因工程151

基因传递的类型和意义152

转化152

发现转化现象152

转化机制153

转化的意义154

转导154

发现转导现象154

转导的机制154

转导的意义156

接合156

发现接合现象156

接合的机制156

接合的意义158

基因传递机制的比较158

质粒159

质粒的特征159

抗性质粒159

转座子160

细菌素原161

基因工程161

基因融合162

原生质体融合162

基因扩增162

重组DNA技术163

杂交瘤166

重组DNA技术的利与弊166

知识点回顾167

临床案例研究169

辩证思考题169

自测题169

网上学习170

第九章 分类学引论——细菌171

分类学：分类的科学172

林奈，分类学之父172

使用分类检索表173

分类学中的问题174

林奈时代后的发展174

五界分类系统175

原核生物界175

原生生物界176

真菌界176

植物界176

动物界177

三域分类系统177

原核生物的进化177

以灌木取代生命之树179

古生菌179

病毒的分类180

进化关系的研究180

研究原核生物的特殊方法181

数值分类学182

基因同源性182

其他技术184

研究意义185

细菌的分类和命名185

细菌分类依据185

伯杰氏手册的历史和意义186

细菌分类的相关问题187

细菌命名法189

第一版伯杰氏手册的细菌部分189

细菌分类与你的关系190

知识点回顾191

临床案例研究192

辩证思考题192

自测题192

网上学习193

第十章 病毒194

病毒的一般特征195

什么是病毒？195

病毒的组成195

大小和形状196

宿主范围及病毒专一性196

病毒的起源198

病毒的分类198

RNA病毒200

DNA病毒202

新显病毒204

病毒的复制205

复制的一般特征205

噬菌体的复制205

溶原性208

动物病毒的复制210

隐性病毒感染212

动物病毒的培养212

培养方法的发展212

细胞培养类型213

病毒和畸形发生214

病毒类似因子：卫星病毒，类病毒，朊病毒214

卫星病毒214

丁型肝炎病毒214

类病毒215

朊病毒215

病毒和癌症216

人类癌症病毒216

癌症病毒是怎样致癌的217

致癌基因217

知识点回顾218

临床案例研究219

辩证思考题219

自测题219

网上学习221

第十一章 真核微生物和寄生物222

寄生物学原理223

寄生的意义223

寄生物与其宿主间的关系223

原生生物224

原生生物的特征224

原生生物的重要性224

原生生物的分类225

真菌229

真菌的特征229

真菌的重要性230

真菌的分类231

蠕虫233

蠕虫的特征233

寄生性蠕虫234

节肢动物237

节肢动物的特征237

节肢动物的分类237

知识点回顾239

临床案例研究240

辩证思考题240

自测题240

网上学习241

第十二章 灭菌和消毒242

灭菌和消毒的原理243

微生物生长的控制243

化学抗微生物法244

化学药剂的效力244

化学药剂效力评价244

消毒剂的选择245

化学抗微生物剂的作用机理245

特殊的化学抗微生物剂246

物理抗微生物方法250

热灭菌的原理和应用250

干热灭菌、湿热灭菌和巴斯德法250

冷藏、冷冻、干燥和冷冻干燥253

微波辐射255

声波和超声波255

过滤255

渗透压256

知识点回顾257

临床案例研究258

辩证思考题258

自测题258

网上学习259

第十三章 抗微生物疗法260

抗微生物化学疗法261

化学疗法的历史261

抗微生物药物的一般性质262

选择性毒性262

活性谱262

作用机理263

几种副作用265

微生物的耐药性265

测定微生物对抗微生物药物的敏感性268

纸片扩散法268

稀释法269

血清杀伤力269

自动化方法269

理想抗微生物药物的属性269

抗菌药物270

细胞壁合成抑制剂270

细胞膜破坏剂272

蛋白质合成抑制剂273

核酸合成抑制剂274

抗代谢药物和其他抗菌药物274

抗真菌药物277

抗病毒药物278

抗原生动物药物279

抗蠕虫类药物279

耐药性医院内感染的特殊问题281

知识点回顾282

临床案例研究284

辩证思考题284

自测题284

网上学习285

第十四章 宿主-微生物关系和致病过程286

宿主-微生物关系287

共生287

污染、感染和疾病288

病原体、致病性和毒力288

正常（固有）微生物菌群288

科赫定理290

疾病种类291

感染性和非感染性疾病291

疾病的分类291

传染病和非传染病292

疾病过程292

微生物是如何致病的292

症状、体征和综合征297

感染性疾病的种类297

感染性疾病的分期298

感染性疾病——过去、现在和将来300

知识点回顾301

临床案例研究302

辩证思考题303

自测题303

网上学习304

第十五章 流行病学和院内感染305

流行病学306

什么是流行病学？306

群体中的疾病306

流行病学研究308

传染源309

入口311

出口312

疾病传播方式312

疾病周期315

群体免疫315

控制疾病的传播316

公共卫生组织318

须申报疾病319

院内感染322

院内感染流行病学322

院内感染的预防与控制324

生物恐怖325

知识点回顾328

临床案例研究328

辩证思考题329

自测题329

网上学习330

第十六章 天然宿主防御331

天然免疫和适应性免疫332

物理屏障332

化学屏障332

细胞防御333

防御细胞333

吞噬细胞334

吞噬过程335

细胞外杀菌336

淋巴系统336

炎症338

炎症的特征338

急性炎症过程338

修复和再生339

慢性炎症339

发烧340

分子防御340

干扰素340

补体342

急性期反应344

知识点回顾345

临床案例研究346

辩证思考题346

自测题346

网上学习347

第十七章 免疫学Ⅰ：适应性免疫及免疫作用的基本原理348

免疫学和免疫349

免疫的类型349

适应性免疫349

主动免疫和被动免疫349

免疫系统的特征350

抗原和抗体350

免疫细胞和免疫组织351

免疫系统的双重应答351

免疫应答的一般特性352

体液免疫353

抗体（免疫球蛋白）的特性354

初次应答和再次应答356

抗原-抗体反应的种类357

单克隆抗体358

细胞介导免疫359

细胞介导的免疫反应359

杀伤细胞的作用机理360

激活巨噬细胞的作用360

超抗原360

黏膜免疫系统361

修饰免疫应答的因素361

免疫接种362

主动免疫接种362

疫苗的危险性364

被动免疫接种366

免疫接种的未来发展366

对各种病原体的免疫367

细菌367

病毒367

真菌368

原生动物及寄生虫368

知识点回顾369

临床案例研究371

辩证思考题371

自测题371

网上学习372

第十八章 免疫学Ⅱ：免疫性疾病及其检验373

免疫性疾病概述374

超敏反应374

免疫缺陷374

速发型（Ⅰ型）超敏反应374

变应原375

速发型超敏反应机制375

局部过敏反应376

全身过敏反应377

过敏症的遗传因素377

过敏症治疗377

细胞毒性（Ⅱ型）超敏反应378

细胞毒性超敏反应机制378

细胞毒性反应举例378

免疫复合物（Ⅲ型）超敏反应380

免疫复合物疾病的机制380

免疫复合物疾病举例380

细胞介导（Ⅳ型）超敏反应381

细胞介导反应的作用机制381

细胞介导疾病举例381

自身免疫性疾病383

自身免疫383

自身免疫性疾病举例384

移植385

组织相容性抗原386

移植排斥387

妊娠期胎儿的耐受性387

免疫抑制387

药物反应388

免疫缺陷疾病388

原发性免疫缺陷疾病388

获得性免疫缺陷疾病389

免疫学检测393

沉淀素试验393

凝集反应394

标记抗体试验396

知识点回顾397

临床案例研究399

辩证思考题399

自测题399

网上学习400

第十九章 皮肤和眼睛疾病；创口和咬伤401

皮肤、黏膜和眼睛402

皮肤402

黏膜402

眼睛402

皮肤的正常菌群403

皮肤病403

细菌性皮肤病404

病毒性皮肤病406

真菌性皮肤病411

其他皮肤病413

眼睛疾病414

细菌性眼病414

病毒性眼病415

寄生虫性眼病415

创口和咬伤417

创口感染417

其他厌氧菌感染417

节肢动物咬伤及相关疾病418

知识点回顾420

临床案例研究421

辩证思考题421

自测题421

网上学习422

第二十章 泌尿生殖系统及性传播性疾病423

泌尿生殖系统的组成424

泌尿系统424

女性生殖系统424

男性生殖系统425

泌尿生殖系统的正常微生物菌群425

通常为非性传播的泌尿生殖系统疾病426

细菌性泌尿生殖系统疾病426

寄生虫性泌尿生殖系统疾病429

性传播疾病430

获得性免疫缺陷综合征（艾滋病）430

细菌性性传播疾病430

病毒性性传播疾病437

知识点回顾442

临床案例研究443

辩证思考题443

自测题443

网上学习444

第二十一章 呼吸系统疾病445

呼吸系统的组成446

上呼吸道446

下呼吸道446

耳447

呼吸系统的正常微生物菌群447

上呼吸道疾病448

细菌性上呼吸道疾病448

病毒性上呼吸道疾病450

下呼吸道疾病452

细菌性下呼吸道疾病452

病毒性下呼吸道疾病459

真菌性下呼吸道疾病464

寄生虫性下呼吸道疾病465

知识点回顾466

临床案例研究467

辩证思考题467

自测题468

网上学习469

第二十二章 口腔和胃肠道疾病470

消化系统的组成471

口腔471

胃471

小肠471

大肠472

口腔和消化系统的正常微生物菌群472

口腔疾病472

口腔的细菌性疾病472

口腔的病毒性疾病475

由细菌引起的胃肠道疾病476

细菌性食物中毒476

细菌性肠炎和肠炎热症477

胃、食管和肠道的细菌性感染483

胆囊和胆道的细菌性感染484

由其他病原体引起的胃肠道疾病485

病毒性胃肠道疾病485

原生动物引起的胃肠道疾病487

真菌毒素的效应489

蠕虫性胃肠道疾病490

知识点回顾496

临床案例研究497

辩证思考题497

自测题497

网上学习498

第二十三章 心血管、淋巴及其系统性疾病499

心血管系统500

心脏和血管500

血液500

心血管系统的正常微生物菌群500

心血管和淋巴系统疾病501

细菌性败血症及相关疾病501

血液和淋巴的肠虫病503

系统性疾病504

细菌性系统性疾病504

立克次体及其相关系统性疾病511

病毒性系统性疾病515

原生动物系统性疾病518

知识点回顾522

临床案例研究523

辩证思考题523

自测题523

网上学习524

第二十四章 神经系统疾病525

神经系统的组成526

神经系统的正常微生态526

脑和脑膜的疾病526

脑和脑膜的细菌性疾病526

脑和脑膜的病毒性疾病528

神经系统的其他疾病532

神经的细菌性疾病532

神经的病毒性疾病535

神经系统的朊病毒疾病536

神经系统的寄生虫疾病538

知识点回顾541

临床案例研究542

辩证思考题542

自测题542

网上学习543

第二十五章 环境微生物学544

生态学基础545

生态系统的特性545

生态系统中的能量流545

生物地球化学循环546

水循环546

碳循环546

氮循环和氮细菌547

硫循环和硫细菌550

其他生物地球化学循环551

深层热生物圈551

空气551

空气中的微生物552

控制空气中微生物的方法552

土壤553

土壤的成分553

土壤中的微生物553

土壤中的病原体554

洞穴555

水555

淡水环境555

海洋环境556

深海火山口557

水污染557

水净化559

污水处理561

一级处理561

二级处理561

三级处理562

化粪池562

生物修复562

知识点回顾564

临床案例研究565

辩证思考题565

自测题565

网上学习566

第二十六章 应用微生物学567

食物中发现的微生物568

谷物类568

果蔬类568

肉禽类569

鱼贝类570

牛奶571

其他食品572

防止食物变质和疾病传播572

食品保藏573

干燥与冷冻干燥574

牛奶巴斯德灭菌575

食品与牛奶的生产标准576

食用微生物和食品生产中的微生物576

食用藻类、真菌和细菌576

食品生产577

啤酒、果酒和白酒580

工业和制药微生物学581

有用的代谢过程581

工业微生物学中的难题582

有用的有机产物582

简单有机化合物582

抗生素583

酶583

氨基酸584

其他生物产品584

微生物采矿584

微生物废物处理585

知识点回顾585

临床案例研究586

辩证思考题586

自测题586

网上学习588

附录A 公制计量单位，换算及数学工具589

附录B 细菌和病毒的分类591

附录C 微生物学中的常见词根608

附录D 处理临床样本中的安全防护610

附录E 代谢途径611

附录F 疾病与对应的病原体615

附录G 病原体及其引起的疾病620

附录H 词汇表625

索引652