图书介绍
肿瘤标志物的计算识别与分析PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- 曹忠波，杜伟，梁艳春著 著
- 出版社： 北京：科学出版社
- ISBN：9787030594372
- 出版时间：2018
- 标注页数：115页
- 文件大小：10MB
- 文件页数：125页
- 主题词：肿瘤－生化性状－识别；肿瘤－生化性状－算法分析
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图书目录
第1章 绪论1
1.1生物信息学1
1.2癌症及标志物简介3
1.3肿瘤标志物研究现状5
第2章 基因芯片基础9
2.1基因芯片概述9
2.1.1基因芯片原理10
2.1.2芯片表达数据分析概要12
2.2基因芯片数据的收集13
2.3基因芯片数据预处理16
2.3.1数据去噪17
2.3.2空值填充策略17
2.3.3数据转换与标准化19
2.4基因芯片数据分析的研究背景及现状21
第3章 癌症表达数据资源及预处理方法26
3.1癌症表达数据来源与处理简介26
3.1.1癌症表达数据的来源26
3.1.2表达数据的矩阵表示及相关处理28
3.2特征选择技术简介30
3.2.1特征选择方法介绍30
3.2.2特征选择算法在生物信息学中的应用31
3.3常用的差异表达基因识别方法34
3.3.1t-test方法34
3.3.2倍数变化法35
第4章 改进的过滤特征选择算法在基因表达数据分析中的应用37
4.1本章概要37
4.2基因芯片的特征选择方法研究背景38
4.3研究方法39
4.3.1数据来源39
4.3.2数据预处理41
4.3.3改进的成对t-test方法41
4.3.4统计显著性评估43
4.3.5冗余基因识别43
4.3.6性能评估45
4.4实验结果51
4.4.1分类准确率评估结果51
4.4.2特征基因的稳定性评估结果58
4.4.3功能稳定性评估结果61
4.4.4功能富集分析评估结果62
4.4.5结果的生物学分析67
4.5本章小结68
第5章 miRNA肿瘤标志物的识别与分析70
5.1本章概要70
5.2miRNA标志物研究背景71
5.3数据来源73
5.3.1成对的miRNA表达数据73
5.3.2循环miRNA信息74
5.4研究方法75
5.4.1每种癌症中差异表达的miRNA的识别75
5.4.2单数据集上特异miRNA标志物的识别76
5.4.3多种癌症间共同的差异表达的miRNA识别78
5.4.4特定癌症类型的组合miRNA标志物识别79
5.4.5差异表达的miRNA靶基因pathway富集分析80
5.4.6评估过程80
5.5实验结果82
5.5.1每种癌症类型差异表达miRNA的识别与分析82
5.5.2多种癌症类型早期阶段的共同标志物识别与分析93
5.6本章小结104
参考文献107