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第1章 小鼠早期胚胎细胞的命运决定1

引言1

胚层的建立和前干细胞程序：囊胚的形成2

胚系的维持和干细胞程序：囊胚以外5

第二胚层决定：ICM的细分5

细胞信号调节PE／EPI形成6

EPI胚层多能性的建立和调节8

结论9

参考文献10

第2章 干细胞的核结构13

引言13

胚胎干细胞核的功能分区13

干细胞其他核质亚区的特点17

胚胎干细胞核特有的染色质特征18

结论19

参考文献20

第3章 细胞多能性的表观遗传学调控23

引言23

表观遗传调控24

胚胎干细胞的表观遗传组学28

结论32

参考文献33

第4章 哺乳动物早期发育阶段常染色体复制域的莱昂化37

引言37

复制时序编程：对基因组结构的初步测定38

一种在进化上相对保守的表观遗传学印记43

复制时序作为染色体三维结构的定量指标44

复制时序反映表观遗传特征的改变：常染色体在外胚层阶段的莱昂化46

复制时序及细胞重编程：常染色体莱昂化的进一步证明47

复制时序程序的维持和改变及其潜在作用48

结论49

参考文献50

第5章 小鼠胚胎干细胞基因组完整性的保持54

引言和历史观点54

体细胞的突变频率56

小鼠ES细胞基因组的保护57

结论64

参考文献65

第6章 胚胎干细胞的转录调控68

引言68

胚胎干细胞可作为研究转录调控的模型细胞69

转录因子决定胚胎干细胞的多能性69

转录调控网络72

转录调控网络分析技术72

转录调控网络核心：Oct4、Sox2和Nanog73

扩大化的转录调控网络75

增强体：转录因子复合体76

信号通路参与转录网络77

转录调控与表观遗传学调控的相互作用78

结论79

参考文献79

第7章 干细胞自我更新和分化中的选择性剪接82

引言82

选择性剪接的概述82

干细胞干性维持及分化中涉及的选择性剪接基因84

基因组学方法鉴别、检测选择性剪接86

RNA结合蛋白对选择性剪接的调控87

结论和展望90

参考文献90

第8章 微小RNA调节胚胎干细胞自我更新和分化93

引言：自我更新程序93

胚胎干细胞94

微小RNA的生成和功能94

促进自我更新的ESCC miRNA95

ESC分化过程中诱导的miRNA阻止自我更新程序97

控制miRNA表达的调节网络99

miRNA能促进或抑制IPS细胞分化99

成体干细胞中的miRNA100

肿瘤细胞中的miRNA100

结论101

参考文献101

第9章 成体干细胞和多能胚胎干细胞中的端粒及端粒酶104

引言104

端粒及端粒酶的调节106

端粒和端粒酶在成体干细胞中的作用107

在体细胞核移植中端粒及端粒酶的调控108

在iPS产生过程中端粒及端粒酶的调控109

端粒酶活性对于产生“高”质量的iPS细胞是必需的110

端粒重编程调控110

结论111

参考文献111

第10章 X染色体失活与胚胎干细胞115

引言115

X染色体失活中的顺势作用因子117

X染色体失活中的反式作用因子118

数量及选择119

沉默与沉默的维持123

X染色体失活与人ES细胞126

结论129

参考文献130

第11章 成体干细胞及其细胞龛137

“龛”的概念、定义与历史137

干细胞龛成分138

与龛功能相关的分子通路140

细胞外基质与细胞-细胞间相互作用141

干细胞龛动态性142

干细胞龛衰老143

恶性干细胞龛143

结论144

参考文献145

第12章 成体干细胞的分化和迁移及其对疾病的影响149

分化149

间充质干细胞152

迁移153

结论157

参考文献158

第13章 脊椎动物再生模型对干细胞应用的启示162

脊椎动物再生模型的属性162

成熟组织再生的机制163

结论180

参考文献181

第14章 成体细胞重编程获得多能性189

引言189

青蛙成体细胞核重编程研究189

克隆羊“多莉”的诞生190

改变细胞命运的因子MyoD（成肌分化抗原）190

通过细胞融合来重编程体细胞190

转染Sox2、Oct3／4、Klf4和c-Myc从而产生诱导多能干细胞191

iPS细胞诱导的方法192

iPS细胞产生的分子机制193

直接重编程：来源于胰腺细胞的β细胞193

直接重编程：来源于成纤维细胞的神经元细胞194

可用于临床的疾病iPS细胞系194

结论195

参考文献195